File manager の Directories をクリックすると下のような画面が表示されます。

1. ディレクトリを作成する時は、New directoryの欄にディレクトリの名前を入力して、Createボタンをクリック。（例えば、/home/yourname/www/new）
2. ディレクトリを削除する時は、まず、ディレクトリの中を空にしてください。その後、Directory nameでディレクトリを選択し、Removeボタンをクリックしてください。